본문 바로가기

Wisdoms131

정족수 감지 (Quorum Sensing) 정족수 감지(Quorum Sensing)는 박테리아가 개별행동을 하는 것이 아니라 무리집단의 범위에서 하는 적응 활동이다. 즉, 더 나은 영양 공급을 위해서 이동할 때나 살아남기 힘든 환경에 대한 방어 체제로써 생체 필름 같은 것을 생성하는 적응을 하는 등의 협력적인 활동을 하는 것을 말한다.정족수 감지 문맥에서 사용되는 용어들은 박테리아 페로몬(bacterial pheromones)이라고 불리는 펩타이드 교환(그와 더불어 다른 분자들)을 교환하는 것에 주로 기반을 두고 있다. 단일 박테리아가 주변의 환경으로 페로몬을 방출하면, 그 농도는 발견되기에 매우 낮을 것이다. 하지만, 군집 밀도가 증가하면, 페로몬의 밀도는 박테리아가 특정 유전자를 활성화 시킬만큼 충분한 수준으로 올라갈 수 있다. 예를 들어, .. 2013. 11. 5.
Cluster of Orthologous Groups (COGs) A collection of homologous genes that are useful for study of evolutionary relationships. A COG consists of orthologues (homologous genes that have diverged in different species from a common ancestral gene, along with the divergence of the species) and paralogues (genes in a single species that have arisen by duplication and divergence) 진화적 관계를 연구하는데 유용한 상동 유전자의 집합. 하나의 COG는 오쏠로그들(상동 유전자들로써 종의 .. 2013. 10. 31.
종속과목강문계 사람에 빗대어서 종(species)가장 작은 분류, 사람종(흑인종, 백인종, 황인종), 서로 자연 상태에서 교배가 가능, sapiens(소문자로 시작) 속(genus)구조적으로 동일하거나 계통 발생적으로 관련 있는 분류, Homo(대문자로 시작) 과(family)유사한 특성을 지닌 속을 묶은 분류. 가령, 사람, 오랑우탄, 고릴라, 침팬지 등은 사람과(Hominidae)에서 뻣어나옴, 이는 대형 유인원류이다. 목(order)유사한 특성을 지닌 과를 묶은 분류. 가령, 영장류는 영장목(Primates)에 속하는 포유류로 원원류(여우원숭이와 로리스, 갈라고, 안경원숭이 포함)와 진원류(원숭이와 유인원)를 포함하고 있다. 강(class)유사한 특성을 지닌 목을 묶은 분류. 사람은 포유류로 포유류 또는 젖먹이 짐승은 척삭동물문.. 2013. 10. 31.
[NGS 분석] Singleton reads Singleton read는 genome assembly가 되지 않은 read이다. Genome assembly를 하기 위해서는 Genome에서 추출된 fragment의 서열을 담은 많은 양의 read들이 필요하다. Singleton이 Computer Science에서는 단일 객체를 생성하는 설계 패턴의 이름이기 때문에 처음 이 용어를 접했을 때 약간 헷갈렸다. 2013. 10. 30.

티스토리툴바