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Wisdoms131

Parametric statistic from: wikipedia.com 모수 통계는 데이터가 특정 확률 분포에서 왔고, 해당 분포의 모수에 대한 추론을 수행하는 것을 가정하는 확률 분야이다. 가장 잘 알려진 기초 확률 방법론들은 모수 통계이다. 모수 모델과 비모수 모델 사이의 차이점은 전자가 고정된 모수를 가지고 있는 동안, 후자는 훈련 데이터의 크기에 따라 모수의 개수가 증가하는 점이다. 일반적으로 말해서, 모수 방법론은 비모수 방법보다 더 많은 가정을 한다. 만약, 그러한 추가적인 가정들이 옳다면, 모수 방법론은 더 정확한 예측을 도출할 수 있다. 모수 방법론은 더 큰 통계적 검정력을 가지고 있다고 알려져 있다. 하지만, 만약 가정이 틀리다면, 모수 방법은 크게 틀릴 수 있다. 그런 이유로, 모수 방법론은 강건(robust)하지 않다고.. 2015. 5. 10.
[bwt] 정리 one of intervals => suffix array indexA suffix array contains suffix array elementssuffix array[suffix array index] => a suffix array elementA suffix array element contains string id (or read id) and the positions To check if the k-mers came from the same read, we need to update the interval by using the current string 2015. 4. 11.
[bwt] suffix array 관련 정리 1. BWT and SAGiven a string S, a sorted suffix array SA,BWT[i] = S[SA[i] - 1] 2. Backward search 2-1. Rank Functionrank() sometimes is named with occurrence()rank() counts the number of an alphabet up to a certain position.In practice, we uses sampled cumulative alphabet counters.Given a pattern P, a global alphabet counter C, a low suffix array index l, a high suffix array index h,for (i = len(.. 2015. 3. 27.
[Oracle VMBox] Protocol Error 공유 폴더(Window host, linux guest) 주의: 공유 폴더는 host OS의 홈 폴더나 기본 폴더가 아니어야 한다. 이를 따르지 않으면 Protocol Error 등을 보게 된다. Oracle VM guest additions를 설치한다. host OS의 임의의 폴더를 생성한다. (특수 기호는 되도록 넣지 않는다.), 가령 C:/vm_share 폴더를 생성한다. Oracle VM GUI에서 설정을 누르고, 공유 폴더 탭에서 C:/vm_share를 선택하고, 자동 마운트 옵션을 켠다. guest OS의 홈 폴더에 임의의 폴더를 생성하되, host OS의 폴더명과 다르게 한다. 가령 /home//shared_files 해당 폴더의 permission을 변경한다.chmod 777 ~/shared_files 마운팅 한다.sudo mount -t vbo.. 2015. 3. 27.