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Biology/Terms

Cluster of Orthologous Groups (COGs)

by 임은천 2013. 10. 31.

A collection of homologous genes that are useful for study of evolutionary relationships. A COG consists of orthologues (homologous genes that have diverged in different species from a common ancestral gene, along with the divergence of the species) and paralogues (genes in a single species that have arisen by duplication and divergence)


진화적 관계를 연구하는데 유용한 상동 유전자의 집합. 하나의 COG는 오쏠로그들(상동 유전자들로써 종의 분화와 함께, 공통 조상 유전자로 부터 다른 종으로 분화된 것을 뜻함, 편역하자면, 공통 조상에서 유래하여 서로 다른 종에 존재하는 유전자)과 패러로그들(유전자 복제와 분화에 의해 나타난 단일 종의 유전자들, 편역하자면, 하나의 유전체 내에서 유전자 복제와 분화에 의해 나타나게된 연관된 유전자들)


COGs category


RNA processing and modification

B

Chromatin Structure and dynamics

C

Energy production and conversion

D

Cell cycle control and mitosis

E

Amino Acid metabolism and transport

F

Nucleotide metabolism and transport

G

Carbohydrate metabolism and transport

H

Coenzyme metabolism

I

Lipid metabolism

J

Translation

K

Transcription

L

Replication and repair

M

Cell wall/membrane/envelop biogenesis

N

Cell motility

O

Post-translational modification, protein turnover, chaperone functions

P

Inorganic ion transport and metabolism

Q

Secondary Structure

T

Signal Transduction

U

Intracellular trafficing and secretion

Y

Nuclear structure

Z

Cytoskeleton

R

General Functional Prediction only

S

Function Unknown


COGs 분류


RNA 처리 및 변경

B

염색질 구조와 역학 관계

C

에너지 생산과 변환

D

세포 주기 제어와 유사 분열

E

아미노산 대사와 수송

F

뉴클레오티드 대사와 수송

G

탄수화물 대사와 수송

H

보조효소 대사

I

지질 대사

J

번역

K

전사

L

복제와 교정

M

세포벽/세포막/세포껍질 생체내 합성

N

세포 운동성

O

번역 후 변경, 단백질 전환, 셰프론 기능

P

생체내 이온 수송 및 대사

Q

이차 구조

T

신호 전달

U

세포 내 수송과 분비

Y

핵의 구조

Z

세포 골격

R

막연한 기능 예측 전용

S

기능이 알려지지 않음


셰프론은 합성중이거나 삼차원 구조가 풀린 폴리펩티드에 붙어 제 구조를 회복시키거나, 폴리펩티드가 세포막을 잘 통과하도록 안내하는 단백질이다. 즉, 단백질의 접힘(폴딩)에 관여하여 고차구조 형성을 보조하는 단백질의 총칭.

신호전달에 의해 호르몬이나 신경전달물질, 세포생장인자의 신호가 세포 내로 전달되어 생리작용이 발현하게 된다..


출처: Tatusov, R.L., Koonin, E.V. and Lipman, D.J. (1997) Science 278, 631-637, http://ecoliwiki.net/colipedia/index.php/Clusters_of_Orthologous_Groups_(COGs)

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