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Bioinformatics/Technology

프레드 품질 점수(Phred quality score)

by 임은천 2013. 4. 3.

본 내용은 http://www.somewhereville.com/?tag=phred-quality-score의 데이터를 보인다.


프레드 품질 점수는 에러가 발생할 확률을 계산하기 위해서 사용된다. FASTAQ나 QSEQ 파일 등을 살펴 보면 아스키 표현 형태로 되어 있고, 이 값은 각각 사용된 퀄리티 값에 따라서 각각의 염기가 에러일 확률로 나타난다.


 프레드 품질 점수(Q), 오류 염기 확률, 생어, 일루미나 1.3+ 아스키 형태

 프레드 Q

 오류 염기 확률

생어 (Q+33) 값 

생어 아스키

일루미나 1.3+ (Q+64) 값

일루미나 1.3+ 아스키 

00

1.0000000000

033

!

064

@

01

0.7943282347

034

065

A

02

0.6309573445

035

#

066

B

03

0.5011872336

036

$

067

C

04

0.3981071706

037

%

068

D

05

0.3162277660

038

&

069

E

06

0.2511886432

039

070

F

07

0.1995262315

040

(

071

G

08

0.1584893192

041

)

072

H

09

0.1258925412

042

*

073

I

10

0.1000000000

043

+

074

J

11

0.0794328235

044

,

075

K

12

0.0630957344

045

-

076

L

13

0.0501187234

046

.

077

M

14

0.0398107171

047

/

078

N

15

0.0316227766

048

0

079

O

16

0.0251188643

049

1

080

P

17

0.0199526231

050

2

081

Q

18

0.0158489319

051

3

082

R

19

0.0125892541

052

4

083

S

20

0.0100000000

053

5

084

T

21

0.0079432823

054

6

085

U

22

0.0063095734

055

7

086

V

23

0.0050118723

056

8

087

W

24

0.0039810717

057

9

088

X

25

0.0031622777

058

:

089

Y

26

0.0025118864

059

;

090

Z

27

0.0019952623

060

<

091

[

28

0.0015848932

061

=

092

\

29

0.0012589254

062

>

093

]

30

0.0010000000

063

?

094

^

31

0.0007943282

064

@

095

_

32

0.0006309573

065

A

096

`

33

0.0005011872

066

B

097

a

34

0.0003981072

067

C

098

b

35

0.0003162278

068

D

099

c

36

0.0002511886

069

E

100

d

37

0.0001995262

070

F

101

e

38

0.0001584893

071

G

102

f

39

0.0001258925

072

H

103

g

40

0.0001000000

073

I

104

h

41

0.0000794328

074

J

105

i

42

0.0000630957

075

K

106

j

43

0.0000501187

076

L

107

k

44

0.0000398107

077

M

108

l

45

0.0000316228

078

N

109

m

46

0.0000251189

079

O

110

n

47

0.0000199526

080

P

111

o

48

0.0000158489

081

Q

112

p

49

0.0000125893

082

R

113

q

50

0.0000100000

083

S

114

r

51

0.0000079433

084

T

115

s

52

0.0000063096

085

U

116

t

53

0.0000050119

086

V

117

u

54

0.0000039811

087

W

118

v

55

0.0000031623

088

X

119

w

56

0.0000025119

089

Y

120

x

57

0.0000019953

090

Z

121

y

58

0.0000015849

091

[

122

z

59

0.0000012589

092

\

123

{

60

0.0000010000

093

]

124

|

61

0.0000007943

094

^

125

}

62

0.0000006310

095

_

126

~

63

0.0000005012

096

`

64

0.0000003981

097

a

65

0.0000003162

098

b

66

0.0000002512

099

c

67

0.0000001995

100

d

68

0.0000001585

101

e

69

0.0000001259

102

f

70

0.0000001000

103

g

71

0.0000000794

104

h

72

0.0000000631

105

i

73

0.0000000501

106

j

74

0.0000000398

107

k

75

0.0000000316

108

l

76

0.0000000251

109

m

77

0.0000000200

110

n

78

0.0000000158

111

o

79

0.0000000126

112

p

80

0.0000000100

113

q

81

0.0000000079

114

r

82

0.0000000063

115

s

83

0.0000000050

116

t

84

0.0000000040

117

u

85

0.0000000032

118

v

86

0.0000000025

119

w

87

0.0000000020

120

x

88

0.0000000016

121

y

89

0.0000000013

122

z

90

0.0000000010

123

{

91

0.0000000008

124

|

92

0.0000000006

125

}

93

0.0000000005

126

~



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